На пункции фолликулов эмбриолог работает в тандеме с врачом и медсестрой. Просматривает фолликулярную жидкость под бинокуляром, находит ооцит-кумулюсные комплексы (именно в них находятся яйцеклетки), переносит их в заранее подготовленные чашки с культуральной средой, помещает в инкубатор.
Эмбриолог оценивает полученные образцы эякулята и проводит их подготовку к оплодотворению, чтобы отобрать фракцию самых подвижных спематозоидов. При необходимости использования замороженного образца — размораживает виалу (небольшой сосуд с образцом) и также подготавливает сперму.